- Административно-хозяйственный отдел
- Отдел медицинской статистики и аналитической обработки медицинской информации
- Отдел сопровождения программного обеспечения и сетевых технологий
- Отдел внедрения региональной медицинской информационной системы (РМИС)
- Отдел внедрения сетевых технологий РМИС (или отдел системного программного обеспечения сетевых технологий РМИС)
- Отдел по безопасности информационных систем (или отдел защиты информации)